La première visite chez le naturopathe dure en moyenne 1h30. Elle débute toujours par une anamnèse, questionnaire très approfondi, pour bien comprendre l’état de la personne, son historique vis-à-vis de sa santé. C’est une vraie enquête pour déterminer les sources, les causes les plus profondes de son mal-être actuel en passant en revue ses antécédents familiaux, sa profession, ses habitudes alimentaires, ses activités physiques, ses temps de loisir ainsi que chacun des secteurs physiologiques, pour pointer ce qui semble satisfaisant ou à améliorer. Le naturopathe va par exemple questionner la personne pour établir des échelles de confort sur le plan digestif, moral, sur la qualité du sommeil, la libido, les articulations, le transit, le niveau de stress, les allergies, les fonctions ORL, urinaires ou cutanées…

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Contrairement au médecin qui pose un diagnostic, le naturopathe se base sur un dialogue approfondi avec son patient. Ensuite, selon les qualifications du praticien de santé et ses outils à disposition, un examen morphologique (typologie, morphopsychologie, caractérologie), iridologique (étude de la partie colorée de l’œil), parfois pulsologie (prise des pouls énergétiques chinois)... Il pourra déboucher aussi sur un bilan de terrain (bioélectronique, cristallisations sensibles). Ce bilan détermine quatre éléments du consultant :

- sa constitution, c’est à dire son potentiel héréditaire immuable

- son tempérament, fruit de ses habitudes de vie

- sa diathèse, qui constitue son état physio-psycho-énergétique du moment

- sa vitalité, énergie intrinsèque qui permettra l'auto-guérison.

Pour clore la séance, le praticien propose un programme d’hygiène vitale, riche de conseils naturopathiques. Il constitue un important dialogue pédagogique qui encourage et responsabilise le patient sur la ré-harmonisation de son quotidien (corrections nutritionnelles, proposition de cures saisonnières, pratique d’exercices physiques, relaxation, respiration, contacts avec la nature, surveillance des éliminations). Les visites suivantes durent environ 45 minutes. La fréquence des visites de suivi peut varier en fonction des recommandations admises dans le programme d’hygiène vitale, mais en général, seulement 3 consultations suffisent à réharmoniser l'organisme.

Une visite de contrôle tous les 6 mois à 1 an est conseillée par la suite.